אחסון אתרים הוא נושא רגיש לא פחות מכתיבת האתר עצמו. אחסון האתר שנבנה בעמל רב באינטרנט חייב גם הוא להיות מותאם למטרה שלשמה נכתב האתר, אחרת הוא מחטיא את המטרה שלו או לכל הפחות מקטין את היכולת של בעלי האתר למקסם את התועלת ממנו.
בחירת דומיין ומטרת האתר
ברוב המקרים, המטרה של אתר היא יצירת רווחים. לפיכך, על בונה האתר לבחור לו שם דומיין קליט,קצר ככל האפשר וייצוגי. אחסון אתרים בצורה כזאת מאפשר לפרסם את האתר בקלות וכך הוא יהיה קליט יותר בקרב קהל היעד שלו. כמו כן, שם אתר קצר מונע אפשרות לחיקויים, ההולכים ומתרבים ככל
שהאתר הופך למצליח יותר. סוג ההונאה הזה נקרא Fishing ומפנה את מי שמקליד שם אתר קרוב, לאתר שונה לגמרי מזה שביקש להגיע אליו.
יש להחליט מראש על סיומת האתר. הסיומת COM היא סיומת כללית. הסיומת IL היא סיומת המאפיינת אתרים מישראל. אם האתר פונה אך ורק לגולשים ישראלים, אפשר וכדאי להשתמש בסיומת הישראלית. אם יש בכוונת מייסדי האתר לפנות גם לקהלי יעד אחרים, כדאי לבחור את הסיומת COM.
אחסון אתרים ונפח האתר.
נפח האתר וכמות התנועה הצפויה בו משפיעים בהחלט על בחירת סוג האחסנה. ישנן חברות המציעות אחסנה חינם, אבל מדברות על נפח אתר קטן, שאיננו מאפשר קיומן של פונקציות רבות וביניהן אפשרות תקשורת אונליין עם הגולשים. אחסון אתרים המתבצע בשיטה כזאת מאפשר לחברה המאחסנת לערוך שינויים באתר ולשלב בו פרסומות גלויות או קופצות. פרסומות כאלה יוצרות בעיני גולשים רבים דימוי של אתר לא רציני. שיטה זו איננה מאפשרת פתיחת תיבות דואר.
אם מדובר בנפח גדול יותר, ואם מדובר במסדי נתונים כבדים שיאוחסנו בשרתים, כדאי לבחור חברה המסוגלת לספק שירותי אחסון אתרים מיני ייעודיים ((VPS המעניקה מחיצה בתוך השרת לנתוני האתר ומערכת הפעלה ייחודית. נפח נתונים ענק מצריך שרתים ייעודיים הכוללים את האתר בלבד ורק אותו. מחיר האחסון במקרה כזה הוא, כמובן, גדול שבעתיים. אתר גדול במיוחד מצריך כמה שרתים במקובץ.